Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
CENPBP07199 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
CENPBP07199 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
CENPBP07199 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CENPBP07199 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CENPBP07199 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
CENPBP07199 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
CENPBP07199 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CENPBP07199 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CENPBP07199 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms