Protein–RNA interactions for Protein: O95295

SNAPIN, SNARE-associated protein Snapin, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPINO95295 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNAPINO95295 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNAPINO95295 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms