Protein–RNA interactions for Protein: O94983

CAMTA2, Calmodulin-binding transcription activator 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMTA2O94983 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CAMTA2O94983 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CYP2D8P-201ENST00000433633 1490 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CAMTA2O94983 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms