Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
CCDC162PA2VCL2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CCDC162PA2VCL2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms