Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC12.26□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms