Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms