Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4C0

NRXN3, Neurexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 1,643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRXN3Q9Y4C0 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
NRXN3Q9Y4C0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NRXN3Q9Y4C0 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NRXN3Q9Y4C0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms