Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 DNAJC27-AS1-204ENST00000428614 780 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
SNX12Q9UMY4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
SNX12Q9UMY4 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms