Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKR5

ERG28, Probable ergosterol biosynthetic protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERG28Q9UKR5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
ERG28Q9UKR5 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
ERG28Q9UKR5 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms