Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CDH22Q9UJ99 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CDH22Q9UJ99 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms