Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SMPXQ9UHP9 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SMPXQ9UHP9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms