Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
ZDHHC3Q9NYG2 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms