Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX36

DNAJC28, DnaJ homolog subfamily C member 28, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC28Q9NX36 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DNAJC28Q9NX36 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms