Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW64

RBM22, Pre-mRNA-splicing factor RBM22, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 420 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM22Q9NW64 ATG13-223ENST00000577256 613 ntTSL 417.75■□□□□ 0.433e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-225ENST00000579280 498 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-228ENST00000581438 619 ntTSL 317.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-230ENST00000583249 544 ntTSL 517.65■□□□□ 0.423e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-226ENST00000580238 624 ntTSL 417.04■□□□□ 0.323e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.283e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 FAM171A1-202ENST00000455654 605 ntTSL 316.71■□□□□ 0.273e-9■■■■■ 26.9
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RBM22Q9NW64 WDR18-211ENST00000607440 1397 ntTSL 516.64■□□□□ 0.263e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-202ENST00000395549 937 ntTSL 516.48■□□□□ 0.233e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 RXRA-201ENST00000356384 5770 ntTSL 516.44■□□□□ 0.222e-6■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.223e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 TTC31-210ENST00000464241 1562 ntTSL 1 (best)16.14■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-229ENST00000582547 600 ntTSL 416.12■□□□□ 0.173e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-217ENST00000530942 552 ntTSL 416.02■□□□□ 0.163e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-201ENST00000251289 1501 ntTSL 515.99■□□□□ 0.153e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-227ENST00000581416 741 ntTSL 315.79■□□□□ 0.123e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-222ENST00000534610 1655 ntTSL 515.69■□□□□ 0.13e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 WDR18-205ENST00000590354 678 ntTSL 215.35■□□□□ 0.053e-9■■■■■ 26.9
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RBM22Q9NW64 TTC31-203ENST00000414247 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 314.84□□□□□ -0.033e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.113e-9■■■■■ 26.9
RBM22Q9NW64 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.143e-7■■■■■ 26.9
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RBM22Q9NW64 PRRC2A-210ENST00000483470 916 ntTSL 28.14□□□□□ -1.112e-9■■■■■ 26.9
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RBM22Q9NW64 ITPR2-207ENST00000540791 575 ntTSL 32.2□□□□□ -2.066e-9■■■■■ 26.9
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RBM22Q9NW64 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.723e-9■■■■■ 26.8
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RBM22Q9NW64 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.093e-9■■■■■ 26.8
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RBM22Q9NW64 FANCA-229ENST00000567988 915 ntTSL 512.36□□□□□ -0.432e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 FANCA-231ENST00000568626 727 ntTSL 312.19□□□□□ -0.462e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 FANCA-232ENST00000568983 726 ntTSL 211.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 HNRNPA2B1-205ENST00000476233 1220 ntTSL 1 (best)4.43□□□□□ -1.71e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.913e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 GOLGA4-209ENST00000450863 1617 ntTSL 519.64■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 GOLGA4-204ENST00000429018 2036 ntTSL 1 (best)15.96■□□□□ 0.153e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 GOLGA4-206ENST00000435830 4152 ntTSL 1 (best)10.34□□□□□ -0.753e-7■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.084e-8■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 SLC38A10-207ENST00000542075 2903 ntTSL 214.35□□□□□ -0.114e-8■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 NHSL1-201ENST00000342260 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 511.47□□□□□ -0.573e-8■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 PRPF4B-205ENST00000480058 6775 ntTSL 1 (best)6.26□□□□□ -1.414e-12■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 PRPF4B-201ENST00000337659 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.38□□□□□ -1.554e-12■■■■■ 26.8
RBM22Q9NW64 EEF2-204ENST00000598182 581 ntTSL 213.48□□□□□ -0.252e-6■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 HNRNPU-225ENST00000640119 461 ntTSL 511.77□□□□□ -0.536e-8■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 PRRC2C-208ENST00000476522 1931 ntTSL 512.37□□□□□ -0.433e-6■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 PRRC2C-204ENST00000426496 10175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.663e-6■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 PRRC2C-206ENST00000467601 717 ntTSL 29.62□□□□□ -0.873e-6■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 PRRC2C-203ENST00000392078 1919 ntTSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.913e-6■■■■□ 26.7
RBM22Q9NW64 PRRC2C-201ENST00000338920 10355 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.113e-6■■■■□ 26.7
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