Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
HELLSQ9NRZ9 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
HELLSQ9NRZ9 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms