Protein–RNA interactions for Protein: Q9HA90

EFCC1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFCC1Q9HA90 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EFCC1Q9HA90 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms