Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LIN28AQ9H9Z2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
LIN28AQ9H9Z2 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms