Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5J8

TAF1D, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1DQ9H5J8 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF1DQ9H5J8 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TAF1DQ9H5J8 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms