Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ3

KRTAP9-3, Keratin-associated protein 9-3, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC109992.2-201ENST00000460977 765 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MGAT4D-201ENST00000503109 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.23□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RPL12P24-201ENST00000474907 486 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.22□□□□□ -0.93
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KRTAP9-3Q9BYQ3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.93
KRTAP9-3Q9BYQ3 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
KRTAP9-3Q9BYQ3 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC9.21□□□□□ -0.94
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