Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CRACR2AQ9BSW2 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CRACR2AQ9BSW2 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms