Protein–RNA interactions for Protein: Q96T51

RUFY1, RUN and FYVE domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUFY1Q96T51 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
RUFY1Q96T51 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms