Protein–RNA interactions for Protein: Q96RS0

TGS1, Trimethylguanosine synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGS1Q96RS0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TGS1Q96RS0 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms