Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB2

COG3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG3Q96JB2 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
COG3Q96JB2 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
COG3Q96JB2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms