Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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RNF185Q96GF1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RNF185Q96GF1 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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