Protein–RNA interactions for Protein: Q96AG4

LRRC59, Leucine-rich repeat-containing protein 59, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC59Q96AG4 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LRRC59Q96AG4 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC59Q96AG4 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms