Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
UTP4Q969X6 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms