Protein–RNA interactions for Protein: Q92973

TNPO1, Transportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 898 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO1Q92973 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
TNPO1Q92973 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms