Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXT5

FOXD4L4, Forkhead box protein D4-like 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L4Q8WXT5 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
FOXD4L4Q8WXT5 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXD4L4Q8WXT5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms