Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC26.91■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
LMO7Q8WWI1 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LMO7Q8WWI1 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
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