Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CCDC107Q8WV48 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CCDC107Q8WV48 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms