Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFR3

SPTSSB, Serine palmitoyltransferase small subunit B, humanhuman

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSBQ8NFR3 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 DENND3-211ENST00000519811 5482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 C20orf203-202ENST00000608990 5076 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SPTSSBQ8NFR3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 327.4 ms