Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBF2

NHLRC2, NHL repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC2Q8NBF2 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NHLRC2Q8NBF2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NHLRC2Q8NBF2 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms