Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4C0

C9orf62, Putative uncharacterized protein C9orf62, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
C9orf62Q8N4C0 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms