Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B4

NUP54, Nucleoporin p54, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP54Q7Z3B4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
NUP54Q7Z3B4 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SPESP1-201ENST00000310673 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
NUP54Q7Z3B4 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms