Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
SYDE1Q6ZW31 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SYDE1Q6ZW31 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms