Protein–RNA interactions for Protein: Q6UW56

ATRAID, All-trans retinoic acid-induced differentiation factor, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRAIDQ6UW56 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
ATRAIDQ6UW56 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ATRAIDQ6UW56 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms