Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT40

FAM78B, Protein FAM78B, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM78BQ5VT40 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM78BQ5VT40 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM78BQ5VT40 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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