Protein–RNA interactions for Protein: Q53HC0

CCDC92, Coiled-coil domain-containing protein 92, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC92Q53HC0 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CCDC92Q53HC0 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms