Protein–RNA interactions for Protein: Q49AH0

CDNF, Cerebral dopamine neurotrophic factor, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDNFQ49AH0 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 HOXC9-203ENST00000508190 1505 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CDNFQ49AH0 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms