Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NDUFA9Q16795 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NDUFA9Q16795 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms