Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.83
CKAP5Q14008 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
CKAP5Q14008 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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