Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

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Length 588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
CCINQ13939 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CCINQ13939 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CCINQ13939 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
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