Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
PEX6Q13608 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PEX6Q13608 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
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