Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ATMQ13315 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
ATMQ13315 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
ATMQ13315 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
ATMQ13315 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
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