Protein–RNA interactions for Protein: Q13112

CHAF1B, Chromatin assembly factor 1 subunit B, humanhuman

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1BQ13112 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CHAF1BQ13112 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CHAF1BQ13112 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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