Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 EIPR1-203ENST00000406835 738 ntTSL 518.85■□□□□ 0.614e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-204ENST00000435721 672 ntTSL 318.85■□□□□ 0.614e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.384e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-205ENST00000441271 647 ntTSL 517.09■□□□□ 0.334e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.164e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-208ENST00000455162 847 ntTSL 510.26□□□□□ -0.774e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 EIPR1-210ENST00000463662 757 ntTSL 38.82□□□□□ -14e-10■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.175e-6■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 NCAPD2-202ENST00000382457 2844 ntTSL 59.79□□□□□ -0.845e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NCAPD2-208ENST00000539714 533 ntTSL 36.71□□□□□ -1.345e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 NCAPD2-210ENST00000541399 584 ntTSL 56.62□□□□□ -1.355e-6■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.897e-7■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 RERE-203ENST00000400907 2973 ntTSL 5 BASIC7.35□□□□□ -1.232e-7■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 ZNF146-203ENST00000586094 565 ntTSL 27.84□□□□□ -1.151e-6■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 MSH2-201ENST00000233146 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.457e-9■■■■□ 19.8
ILF3Q12906 MSH2-202ENST00000406134 3628 ntTSL 1 (best) BASIC8.95□□□□□ -0.987e-9■■■■□ 19.8
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ILF3Q12906 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.672e-7■■■■□ 19.7
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ILF3Q12906 KANK1-205ENST00000382297 5051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.15□□□□□ -0.941e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 GPT2-203ENST00000562132 554 ntTSL 414.78□□□□□ -0.049e-7■■■■□ 19.7
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ILF3Q12906 ATF7IP2-208ENST00000562102 558 ntTSL 45.48□□□□□ -1.537e-7■■■■□ 19.7
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ILF3Q12906 SPG7-214ENST00000566371 581 ntTSL 321.48■■□□□ 1.031e-9■■■■□ 19.7
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ILF3Q12906 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.084e-9■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.947e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 FBXW7-212ENST00000604872 970 ntTSL 1 (best) BASIC9.61□□□□□ -0.877e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 FBXW7-205ENST00000603548 2562 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.67□□□□□ -1.027e-7■■■■□ 19.7
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ILF3Q12906 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.31e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 MCF2L-210ENST00000409954 574 ntTSL 514.51□□□□□ -0.091e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC12.53□□□□□ -0.41e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 MCF2L-213ENST00000421756 3560 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.421e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 MCF2L-202ENST00000375597 3413 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.691e-6■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.466e-11■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 AGPAT3-204ENST00000398061 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.476e-11■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 AGPAT3-208ENST00000448287 454 ntTSL 311.95□□□□□ -0.56e-11■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 IGF2BP3-216ENST00000497563 657 ntTSL 25.67□□□□□ -1.53e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC4.81□□□□□ -1.643e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 IGF2BP3-205ENST00000467592 600 ntTSL 52.93□□□□□ -1.943e-7■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 PEG3-203ENST00000594389 411 ntTSL 322.16■■□□□ 1.143e-8■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 PEG3-204ENST00000594706 583 ntTSL 318.69■□□□□ 0.583e-8■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 PEG3-205ENST00000596261 570 ntTSL 48.06□□□□□ -1.123e-8■■■■□ 19.7
ILF3Q12906 PTBP2-204ENST00000459735 791 ntTSL 58.91□□□□□ -0.986e-13■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 PTBP2-210ENST00000492905 776 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.546e-13■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 PTBP2-208ENST00000476783 779 ntTSL 1 (best)5.4□□□□□ -1.546e-13■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.366e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.16e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 SERPINA1-207ENST00000440909 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.42□□□□□ -0.99e-9■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 SERPINA1-201ENST00000355814 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.919e-9■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 SERPINA1-206ENST00000437397 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.18□□□□□ -0.949e-9■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 SERPINA1-208ENST00000448921 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.19e-9■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-202ENST00000280083 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.525e-7■■■■□ 19.6
ILF3Q12906 CTAGE5-206ENST00000396158 3695 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.745e-7■■■■□ 19.6
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