Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCDC173Q0VFZ6 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms