Protein–RNA interactions for Protein: Q08729

DSE3, Protein DSE3, yeastyeast

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DSE3Q08729 PDR8YLR266C 2106 nt1.96□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 HER1YOR227W 3741 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 VIK1YPL253C 1944 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 AI5_ALPHAQ0070 1893 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YGR151CYGR151C 336 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 TMA7YLR262C-A 195 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 CDC53YDL132W 2448 nt1.95□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 RPH1YER169W 2391 nt1.94□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 TRM3YDL112W 4311 nt1.94□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 BRR2YER172C 6492 nt1.94□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 MNL2YLR057W 2550 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YER088C-AYER088C-A 324 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 UBR1YGR184C 5853 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 SNF5YBR289W 2718 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 UBR2YLR024C 5619 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 MPT5YGL178W 2580 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 INP2YMR163C 2118 nt1.93□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 IRR1YIL026C 3453 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 SPT21YMR179W 2277 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 RTP1YMR185W 2946 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 RTT107YHR154W 3213 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YNL338WYNL338W 159 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YMR045CYMR045C 5268 nt1.92□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 USO1YDL058W 5373 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 RTT101YJL047C 2529 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 PDE2YOR360C 1581 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 YJL150WYJL150W 303 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 SWI5YDR146C 2130 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 VPS54YDR027C 2670 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 MGA2YIR033W 3342 nt1.91□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 HSH155YMR288W 2916 nt1.9□□□□□ -2.1
DSE3Q08729 MUK1YPL070W 1839 nt1.9□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YDR286CYDR286C 345 nt1.9□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 SFB2YNL049C 2631 nt1.9□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 RFX1YLR176C 2436 nt1.9□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 SLM1YIL105C 2061 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 snR72snR72 98 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YHR073W-AYHR073W-A 177 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 PAU18YLL064C 363 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YBL008W-AYBL008W-A 240 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 COA6YMR244C-A 315 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 PAU6YNR076W 363 nt1.89□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YCR043CYCR043C 384 nt1.88□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 VPS55YJR044C 423 nt1.88□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 RPB10YOR210W 213 nt1.88□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 VPS8YAL002W 3825 nt1.88□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 NIP100YPL174C 2607 nt1.87□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 SWI6YLR182W 2412 nt1.87□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YPR092WYPR092W 306 nt1.87□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YHR214C-BYHR214C-B 5382 nt1.87□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 snR74snR74 88 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 OLI1Q0130 231 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YCL046WYCL046W 324 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 ZRG8YER033C 3231 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 LYS14YDR034C 2373 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 TRS65YGR166W 1683 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 PRP39YML046W 1890 nt1.86□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 ADR1YDR216W 3972 nt1.85□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 RRT15YLR162W-A 189 nt1.85□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 NUP192YJL039C 5052 nt1.85□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YLR035C-AYLR035C-A 3468 nt1.85□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 CDC60YPL160W 3273 nt1.84□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt1.84□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 YDR003W-AYDR003W-A 123 nt1.84□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 ATP8Q0080 147 nt1.84□□□□□ -2.11
DSE3Q08729 SPC98YNL126W 2541 nt1.84□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 MET18YIL128W 3099 nt1.84□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 SEC5YDR166C 2916 nt1.84□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 SPO75YLL005C 2607 nt1.83□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YEL014CYEL014C 306 nt1.83□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YHR210CYHR210C 1026 nt1.83□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YIR030W-AYIR030W-A 384 nt1.83□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YLR140WYLR140W 327 nt1.83□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 CHC1YGL206C 4962 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 LRE1YCL051W 1752 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 MYO4YAL029C 4416 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 BPH1YCR032W 6504 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 HSL1YKL101W 4557 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YNL144CYNL144C 2223 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YBR131C-AYBR131C-A 90 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YOR343W-BYOR343W-B 5313 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YKU70YMR284W 1809 nt1.82□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 SLY1YDR189W 2001 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YGL217CYGL217C 342 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 tT(UGU)HtT(UGU)H 72 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YLR342W-AYLR342W-A 174 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YNL097C-BYNL097C-B 123 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YOR376WYOR376W 369 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 SGF11YPL047W 300 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YBR182C-AYBR182C-A 195 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 MNE1YOR350C 1992 nt1.81□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 SRP14YDL092W 441 nt1.8□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 YOR093CYOR093C 4947 nt1.8□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 CAT8YMR280C 4302 nt1.8□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 CAT2YML042W 2013 nt1.79□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 RPS27BYHR021C 249 nt1.79□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 ZRG17YNR039C 1818 nt1.79□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 LHS1YKL073W 2646 nt1.79□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 CTF4YPR135W 2784 nt1.78□□□□□ -2.12
DSE3Q08729 DCP2YNL118C 2913 nt1.78□□□□□ -2.12
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