Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
CACNB2Q08289 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CACNB2Q08289 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms