Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
HOXC5Q00444 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HOXC5Q00444 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms